Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRGP48443 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRGP48443 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RXRGP48443 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RXRGP48443 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRGP48443 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRGP48443 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRGP48443 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRGP48443 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRGP48443 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRGP48443 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRGP48443 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRGP48443 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRGP48443 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRGP48443 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRGP48443 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRGP48443 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRGP48443 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRGP48443 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRGP48443 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRGP48443 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRGP48443 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRGP48443 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRGP48443 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRGP48443 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRGP48443 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRGP48443 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRGP48443 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RXRGP48443 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRGP48443 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRGP48443 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRGP48443 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRGP48443 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRGP48443 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRGP48443 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRGP48443 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRGP48443 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRGP48443 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRGP48443 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRGP48443 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRGP48443 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRGP48443 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRGP48443 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRGP48443 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRGP48443 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRGP48443 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRGP48443 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRGP48443 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRGP48443 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRGP48443 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRGP48443 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRGP48443 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRGP48443 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRGP48443 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRGP48443 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRGP48443 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRGP48443 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRGP48443 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRGP48443 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRGP48443 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRGP48443 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRGP48443 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRGP48443 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRGP48443 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRGP48443 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRGP48443 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRGP48443 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRGP48443 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRGP48443 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRGP48443 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRGP48443 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRGP48443 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRGP48443 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRGP48443 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRGP48443 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRGP48443 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRGP48443 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRGP48443 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRGP48443 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms