Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRATP43155 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRATP43155 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRATP43155 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRATP43155 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRATP43155 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRATP43155 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRATP43155 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRATP43155 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRATP43155 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRATP43155 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRATP43155 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRATP43155 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRATP43155 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRATP43155 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRATP43155 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRATP43155 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRATP43155 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRATP43155 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRATP43155 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRATP43155 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRATP43155 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRATP43155 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRATP43155 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRATP43155 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRATP43155 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRATP43155 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRATP43155 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRATP43155 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRATP43155 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRATP43155 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRATP43155 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRATP43155 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRATP43155 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRATP43155 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRATP43155 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRATP43155 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRATP43155 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRATP43155 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRATP43155 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRATP43155 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRATP43155 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRATP43155 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRATP43155 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRATP43155 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRATP43155 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRATP43155 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRATP43155 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRATP43155 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRATP43155 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRATP43155 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRATP43155 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRATP43155 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms