Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGER3P43115 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGER3P43115 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER3P43115 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms