Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP3P42574 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP3P42574 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP3P42574 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP3P42574 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP3P42574 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP3P42574 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP3P42574 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP3P42574 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP3P42574 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP3P42574 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP3P42574 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP3P42574 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP3P42574 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP3P42574 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP3P42574 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP3P42574 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP3P42574 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP3P42574 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP3P42574 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP3P42574 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP3P42574 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP3P42574 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP3P42574 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP3P42574 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP3P42574 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP3P42574 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP3P42574 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP3P42574 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP3P42574 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP3P42574 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP3P42574 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP3P42574 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP3P42574 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP3P42574 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP3P42574 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP3P42574 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP3P42574 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP3P42574 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP3P42574 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP3P42574 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP3P42574 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP3P42574 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP3P42574 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP3P42574 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP3P42574 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP3P42574 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP3P42574 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP3P42574 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP3P42574 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP3P42574 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP3P42574 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP3P42574 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP3P42574 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms