Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA2P42262 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA2P42262 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIA2P42262 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA2P42262 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms