Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC26A3P40879 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC26A3P40879 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC26A3P40879 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms