Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP8P40818 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP8P40818 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP8P40818 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP8P40818 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP8P40818 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP8P40818 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP8P40818 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP8P40818 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP8P40818 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP8P40818 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP8P40818 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP8P40818 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP8P40818 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP8P40818 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP8P40818 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP8P40818 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP8P40818 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP8P40818 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP8P40818 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP8P40818 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP8P40818 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP8P40818 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP8P40818 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP8P40818 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP8P40818 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP8P40818 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP8P40818 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP8P40818 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP8P40818 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP8P40818 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP8P40818 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP8P40818 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
USP8P40818 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP8P40818 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP8P40818 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP8P40818 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP8P40818 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP8P40818 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP8P40818 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP8P40818 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP8P40818 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP8P40818 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP8P40818 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP8P40818 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP8P40818 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP8P40818 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP8P40818 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP8P40818 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP8P40818 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP8P40818 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP8P40818 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP8P40818 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP8P40818 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP8P40818 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP8P40818 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP8P40818 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP8P40818 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP8P40818 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP8P40818 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP8P40818 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP8P40818 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP8P40818 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP8P40818 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP8P40818 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP8P40818 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP8P40818 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP8P40818 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP8P40818 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP8P40818 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP8P40818 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP8P40818 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms