Protein–RNA interactions for Protein: P36104

SWD2, COMPASS component SWD2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWD2P36104 MKK1YOR231W 1527 nt5.76□□□□□ -1.49
SWD2P36104 HSP12YFL014W 330 nt5.76□□□□□ -1.49
SWD2P36104 DYS1YHR068W 1164 nt5.76□□□□□ -1.49
SWD2P36104 YCL049CYCL049C 939 nt5.76□□□□□ -1.49
SWD2P36104 HOG1YLR113W 1308 nt5.75□□□□□ -1.49
SWD2P36104 YFR006WYFR006W 1608 nt5.75□□□□□ -1.49
SWD2P36104 YDL177CYDL177C 513 nt5.75□□□□□ -1.49
SWD2P36104 COS10YNR075W 1125 nt5.75□□□□□ -1.49
SWD2P36104 BDF2YDL070W 1917 nt5.75□□□□□ -1.49
SWD2P36104 CHS5YLR330W 2016 nt5.75□□□□□ -1.49
SWD2P36104 CLN1YMR199W 1641 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 YLL058WYLL058W 1728 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 DAL4YIR028W 1908 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 MRPS28YDR337W 861 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 YSC83YHR017W 1158 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 PTC7YHR076W 1032 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 YFL052WYFL052W 1398 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 ARP3YJR065C 1350 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 APE4YHR113W 1473 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 FCY22YER060W-A 1593 nt5.74□□□□□ -1.49
SWD2P36104 CMR1YDL156W 1569 nt5.73□□□□□ -1.49
SWD2P36104 URA1YKL216W 945 nt5.73□□□□□ -1.49
SWD2P36104 GCN3YKR026C 918 nt5.73□□□□□ -1.49
SWD2P36104 SUR7YML052W 909 nt5.73□□□□□ -1.49
SWD2P36104 IRC11YOR013W 471 nt5.73□□□□□ -1.49
SWD2P36104 CTF8YHR191C 402 nt5.72□□□□□ -1.49
SWD2P36104 GYP8YFL027C 1494 nt5.71□□□□□ -1.49
SWD2P36104 HIS1YER055C 894 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 MRPL19YNL185C 477 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 TOS6YNL300W 309 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 ERG10YPL028W 1197 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 LGE1YPL055C 999 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YPR076WYPR076W 375 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 ELP3YPL086C 1674 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YMR034CYMR034C 1305 nt5.71□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YJL163CYJL163C 1668 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YJR107WYJR107W 987 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 HMS2YJR147W 1077 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SML1YML058W 315 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 MCP1YOR228C 909 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SPE3YPR069C 882 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 ADH5YBR145W 1056 nt5.7□□□□□ -1.5
SWD2P36104 HSM3YBR272C 1443 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YGL102CYGL102C 429 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 PRI1YIR008C 1230 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 AAD14YNL331C 1131 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YTH1YPR107C 627 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SMX3YPR182W 261 nt5.69□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YHR020WYHR020W 2067 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YJL144WYJL144W 315 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YLL056CYLL056C 897 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 CUE4YML101C 354 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 ZIM17YNL310C 525 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 FIT2YOR382W 462 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 GAA1YLR088W 1845 nt5.68□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YDR415CYDR415C 1125 nt5.67□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YKR032WYKR032W 315 nt5.67□□□□□ -1.5
SWD2P36104 SEC62YPL094C 825 nt5.67□□□□□ -1.5
SWD2P36104 STT3YGL022W 2157 nt5.67□□□□□ -1.5
SWD2P36104 ICP55YER078C 1536 nt5.67□□□□□ -1.5
SWD2P36104 TFC6YDR362C 2019 nt5.67□□□□□ -1.5
SWD2P36104 HEM1YDR232W 1647 nt5.66□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YBL070CYBL070C 321 nt5.66□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YOL046CYOL046C 675 nt5.66□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YPR204WYPR204W 3099 nt5.66□□□□□ -1.5
SWD2P36104 TOS2YGR221C 1869 nt5.66□□□□□ -1.5
SWD2P36104 MSC3YLR219W 2187 nt5.65□□□□□ -1.5
SWD2P36104 PPH21YDL134C 1110 nt5.65□□□□□ -1.5
SWD2P36104 FPR2YDR519W 408 nt5.65□□□□□ -1.5
SWD2P36104 AGX1YFL030W 1158 nt5.65□□□□□ -1.5
SWD2P36104 YPT1YFL038C 621 nt5.65□□□□□ -1.5
SWD2P36104 PPM2YOL141W 2088 nt5.65□□□□□ -1.51
SWD2P36104 GLN3YER040W 2193 nt5.65□□□□□ -1.51
SWD2P36104 HED1YDR014W-A 489 nt5.64□□□□□ -1.51
SWD2P36104 HEM2YGL040C 1029 nt5.64□□□□□ -1.51
SWD2P36104 TMA46YOR091W 1038 nt5.64□□□□□ -1.51
SWD2P36104 DFR1YOR236W 636 nt5.64□□□□□ -1.51
SWD2P36104 HST2YPL015C 1074 nt5.64□□□□□ -1.51
SWD2P36104 YBR113WYBR113W 483 nt5.64□□□□□ -1.51
SWD2P36104 SGE1YPR198W 1632 nt5.63□□□□□ -1.51
SWD2P36104 CDC11YJR076C 1248 nt5.63□□□□□ -1.51
SWD2P36104 COX5AYNL052W 462 nt5.63□□□□□ -1.51
SWD2P36104 PLB3YOL011W 2061 nt5.63□□□□□ -1.51
SWD2P36104 NUP49YGL172W 1419 nt5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms