Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT20P35900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT20P35900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT20P35900 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT20P35900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT20P35900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT20P35900 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT20P35900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT20P35900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT20P35900 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT20P35900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT20P35900 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT20P35900 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT20P35900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT20P35900 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT20P35900 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT20P35900 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT20P35900 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT20P35900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT20P35900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT20P35900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT20P35900 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT20P35900 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT20P35900 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT20P35900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT20P35900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT20P35900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT20P35900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT20P35900 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT20P35900 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT20P35900 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT20P35900 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT20P35900 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT20P35900 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT20P35900 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT20P35900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT20P35900 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT20P35900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT20P35900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT20P35900 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT20P35900 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms