Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX5P35711 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX5P35711 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX5P35711 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX5P35711 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX5P35711 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX5P35711 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX5P35711 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX5P35711 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX5P35711 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX5P35711 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX5P35711 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX5P35711 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX5P35711 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX5P35711 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX5P35711 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOX5P35711 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX5P35711 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX5P35711 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX5P35711 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX5P35711 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX5P35711 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX5P35711 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX5P35711 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX5P35711 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX5P35711 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX5P35711 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX5P35711 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX5P35711 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX5P35711 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX5P35711 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX5P35711 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX5P35711 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX5P35711 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX5P35711 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX5P35711 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX5P35711 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX5P35711 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX5P35711 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX5P35711 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX5P35711 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX5P35711 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX5P35711 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX5P35711 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX5P35711 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX5P35711 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX5P35711 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX5P35711 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX5P35711 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX5P35711 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX5P35711 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX5P35711 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX5P35711 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX5P35711 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX5P35711 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX5P35711 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX5P35711 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX5P35711 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX5P35711 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX5P35711 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX5P35711 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX5P35711 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX5P35711 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX5P35711 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX5P35711 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX5P35711 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX5P35711 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms