Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT9P35527 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT9P35527 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT9P35527 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT9P35527 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT9P35527 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT9P35527 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT9P35527 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT9P35527 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT9P35527 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT9P35527 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT9P35527 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT9P35527 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT9P35527 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT9P35527 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT9P35527 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT9P35527 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT9P35527 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT9P35527 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT9P35527 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT9P35527 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT9P35527 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT9P35527 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT9P35527 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT9P35527 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT9P35527 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT9P35527 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT9P35527 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT9P35527 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT9P35527 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT9P35527 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT9P35527 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT9P35527 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT9P35527 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT9P35527 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT9P35527 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT9P35527 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT9P35527 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT9P35527 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT9P35527 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT9P35527 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT9P35527 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT9P35527 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT9P35527 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT9P35527 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT9P35527 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT9P35527 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT9P35527 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT9P35527 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT9P35527 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT9P35527 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT9P35527 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT9P35527 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT9P35527 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT9P35527 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT9P35527 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT9P35527 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT9P35527 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT9P35527 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT9P35527 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT9P35527 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT9P35527 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT9P35527 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT9P35527 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT9P35527 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT9P35527 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT9P35527 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT9P35527 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT9P35527 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT9P35527 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT9P35527 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT9P35527 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT9P35527 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT9P35527 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT9P35527 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT9P35527 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms