Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS4P35443 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS4P35443 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS4P35443 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS4P35443 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS4P35443 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
THBS4P35443 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
THBS4P35443 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
THBS4P35443 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
THBS4P35443 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS4P35443 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS4P35443 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS4P35443 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS4P35443 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS4P35443 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS4P35443 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS4P35443 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS4P35443 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS4P35443 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS4P35443 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS4P35443 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS4P35443 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS4P35443 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS4P35443 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS4P35443 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS4P35443 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS4P35443 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS4P35443 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS4P35443 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS4P35443 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS4P35443 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS4P35443 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS4P35443 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS4P35443 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS4P35443 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THBS4P35443 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS4P35443 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS4P35443 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS4P35443 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS4P35443 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS4P35443 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS4P35443 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS4P35443 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS4P35443 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THBS4P35443 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THBS4P35443 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS4P35443 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS4P35443 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS4P35443 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS4P35443 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms