Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP1P32455 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP1P32455 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP1P32455 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP1P32455 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP1P32455 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP1P32455 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP1P32455 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP1P32455 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP1P32455 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP1P32455 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP1P32455 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP1P32455 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP1P32455 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP1P32455 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP1P32455 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP1P32455 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP1P32455 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP1P32455 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP1P32455 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP1P32455 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP1P32455 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP1P32455 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP1P32455 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP1P32455 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP1P32455 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP1P32455 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP1P32455 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP1P32455 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP1P32455 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP1P32455 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP1P32455 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP1P32455 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP1P32455 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP1P32455 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP1P32455 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP1P32455 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP1P32455 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP1P32455 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP1P32455 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP1P32455 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP1P32455 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP1P32455 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP1P32455 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP1P32455 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP1P32455 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP1P32455 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP1P32455 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP1P32455 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP1P32455 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP1P32455 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP1P32455 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP1P32455 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP1P32455 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP1P32455 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP1P32455 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP1P32455 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP1P32455 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP1P32455 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP1P32455 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP1P32455 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP1P32455 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP1P32455 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP1P32455 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP1P32455 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP1P32455 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP1P32455 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP1P32455 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP1P32455 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP1P32455 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP1P32455 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP1P32455 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP1P32455 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms