Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
KDM5AP29375 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5AP29375 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5AP29375 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5AP29375 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms