Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHC1P29353 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHC1P29353 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHC1P29353 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHC1P29353 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHC1P29353 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHC1P29353 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC1P29353 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC1P29353 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC1P29353 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHC1P29353 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHC1P29353 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC1P29353 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHC1P29353 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC1P29353 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC1P29353 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHC1P29353 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC1P29353 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC1P29353 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHC1P29353 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC1P29353 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC1P29353 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC1P29353 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC1P29353 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC1P29353 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHC1P29353 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC1P29353 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC1P29353 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC1P29353 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC1P29353 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC1P29353 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHC1P29353 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHC1P29353 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHC1P29353 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHC1P29353 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHC1P29353 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHC1P29353 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHC1P29353 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHC1P29353 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHC1P29353 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHC1P29353 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHC1P29353 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHC1P29353 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHC1P29353 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHC1P29353 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHC1P29353 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHC1P29353 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHC1P29353 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHC1P29353 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHC1P29353 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHC1P29353 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHC1P29353 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHC1P29353 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHC1P29353 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHC1P29353 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHC1P29353 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHC1P29353 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHC1P29353 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHC1P29353 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHC1P29353 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms