Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB2P29323 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHB2P29323 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB2P29323 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB2P29323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB2P29323 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms