Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRB3P28472 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB3P28472 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms