Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT1P26572 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MGAT1P26572 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT1P26572 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms