Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TACR1P25103 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TACR1P25103 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TACR1P25103 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TACR1P25103 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TACR1P25103 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TACR1P25103 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TACR1P25103 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TACR1P25103 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TACR1P25103 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TACR1P25103 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TACR1P25103 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TACR1P25103 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TACR1P25103 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TACR1P25103 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TACR1P25103 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TACR1P25103 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TACR1P25103 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TACR1P25103 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TACR1P25103 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TACR1P25103 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TACR1P25103 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TACR1P25103 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TACR1P25103 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TACR1P25103 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TACR1P25103 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TACR1P25103 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TACR1P25103 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TACR1P25103 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TACR1P25103 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TACR1P25103 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TACR1P25103 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TACR1P25103 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TACR1P25103 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TACR1P25103 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TACR1P25103 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TACR1P25103 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TACR1P25103 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TACR1P25103 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TACR1P25103 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TACR1P25103 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TACR1P25103 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms