Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA5P22460 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA5P22460 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNA5P22460 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA5P22460 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA5P22460 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms