Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB4AP20338 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms