Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFXP16104 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFXP16104 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFXP16104 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms