Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKCSHP14314 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCSHP14314 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCSHP14314 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCSHP14314 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms