Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCANP13611 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCANP13611 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCANP13611 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCANP13611 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCANP13611 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCANP13611 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCANP13611 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCANP13611 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCANP13611 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VCANP13611 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCANP13611 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCANP13611 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCANP13611 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCANP13611 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCANP13611 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCANP13611 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCANP13611 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VCANP13611 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCANP13611 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCANP13611 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCANP13611 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCANP13611 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCANP13611 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCANP13611 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCANP13611 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCANP13611 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCANP13611 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCANP13611 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCANP13611 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCANP13611 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCANP13611 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCANP13611 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCANP13611 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VCANP13611 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VCANP13611 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VCANP13611 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCANP13611 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCANP13611 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCANP13611 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCANP13611 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCANP13611 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCANP13611 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCANP13611 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCANP13611 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCANP13611 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCANP13611 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCANP13611 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCANP13611 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCANP13611 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCANP13611 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCANP13611 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCANP13611 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCANP13611 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCANP13611 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCANP13611 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCANP13611 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCANP13611 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCANP13611 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCANP13611 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCANP13611 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCANP13611 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCANP13611 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCANP13611 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCANP13611 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VCANP13611 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCANP13611 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCANP13611 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCANP13611 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCANP13611 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VCANP13611 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VCANP13611 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCANP13611 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCANP13611 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCANP13611 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCANP13611 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCANP13611 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCANP13611 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCANP13611 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCANP13611 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCANP13611 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCANP13611 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCANP13611 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCANP13611 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms