Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEPDP12955 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEPDP12955 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEPDP12955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEPDP12955 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEPDP12955 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEPDP12955 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEPDP12955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PEPDP12955 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PEPDP12955 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PEPDP12955 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEPDP12955 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEPDP12955 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEPDP12955 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEPDP12955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEPDP12955 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEPDP12955 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEPDP12955 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEPDP12955 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEPDP12955 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEPDP12955 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEPDP12955 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEPDP12955 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEPDP12955 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEPDP12955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEPDP12955 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEPDP12955 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEPDP12955 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEPDP12955 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEPDP12955 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEPDP12955 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEPDP12955 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEPDP12955 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEPDP12955 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEPDP12955 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEPDP12955 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEPDP12955 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEPDP12955 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PEPDP12955 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEPDP12955 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEPDP12955 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEPDP12955 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEPDP12955 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEPDP12955 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEPDP12955 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEPDP12955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEPDP12955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEPDP12955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEPDP12955 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEPDP12955 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEPDP12955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEPDP12955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEPDP12955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEPDP12955 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEPDP12955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEPDP12955 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEPDP12955 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEPDP12955 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEPDP12955 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEPDP12955 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEPDP12955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEPDP12955 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEPDP12955 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEPDP12955 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEPDP12955 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEPDP12955 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEPDP12955 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEPDP12955 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEPDP12955 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEPDP12955 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms