Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM253P0C7T8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TMEM253P0C7T8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM253P0C7T8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM253P0C7T8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM253P0C7T8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms