Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND2P03891 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND2P03891 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms