Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8AP01732 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8AP01732 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8AP01732 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8AP01732 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8AP01732 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8AP01732 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8AP01732 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8AP01732 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8AP01732 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8AP01732 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8AP01732 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8AP01732 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8AP01732 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8AP01732 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8AP01732 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8AP01732 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8AP01732 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8AP01732 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8AP01732 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8AP01732 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8AP01732 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8AP01732 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8AP01732 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8AP01732 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8AP01732 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8AP01732 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8AP01732 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8AP01732 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8AP01732 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8AP01732 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8AP01732 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD8AP01732 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8AP01732 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8AP01732 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8AP01732 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8AP01732 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8AP01732 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8AP01732 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8AP01732 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8AP01732 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8AP01732 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8AP01732 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8AP01732 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8AP01732 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8AP01732 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8AP01732 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8AP01732 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8AP01732 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8AP01732 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms