Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MBD3O95983 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD3O95983 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD3O95983 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD3O95983 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MBD3O95983 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MBD3O95983 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD3O95983 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD3O95983 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD3O95983 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD3O95983 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD3O95983 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MBD3O95983 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD3O95983 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD3O95983 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MBD3O95983 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD3O95983 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD3O95983 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD3O95983 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD3O95983 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD3O95983 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD3O95983 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD3O95983 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD3O95983 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MBD3O95983 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD3O95983 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD3O95983 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD3O95983 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MBD3O95983 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD3O95983 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD3O95983 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD3O95983 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD3O95983 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD3O95983 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD3O95983 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD3O95983 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD3O95983 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD3O95983 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD3O95983 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD3O95983 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MBD3O95983 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD3O95983 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD3O95983 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD3O95983 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD3O95983 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD3O95983 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD3O95983 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD3O95983 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD3O95983 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD3O95983 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD3O95983 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD3O95983 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD3O95983 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD3O95983 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD3O95983 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD3O95983 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD3O95983 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD3O95983 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD3O95983 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD3O95983 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD3O95983 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD3O95983 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD3O95983 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD3O95983 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD3O95983 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD3O95983 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD3O95983 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD3O95983 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms