Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASA4O43374 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASA4O43374 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASA4O43374 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASA4O43374 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASA4O43374 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASA4O43374 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASA4O43374 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASA4O43374 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASA4O43374 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASA4O43374 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASA4O43374 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASA4O43374 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASA4O43374 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASA4O43374 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASA4O43374 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASA4O43374 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASA4O43374 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RASA4O43374 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASA4O43374 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASA4O43374 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RASA4O43374 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASA4O43374 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASA4O43374 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RASA4O43374 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASA4O43374 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASA4O43374 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASA4O43374 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASA4O43374 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASA4O43374 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASA4O43374 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RASA4O43374 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASA4O43374 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASA4O43374 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASA4O43374 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASA4O43374 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASA4O43374 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASA4O43374 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASA4O43374 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASA4O43374 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASA4O43374 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASA4O43374 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASA4O43374 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASA4O43374 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASA4O43374 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RASA4O43374 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASA4O43374 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASA4O43374 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RASA4O43374 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASA4O43374 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASA4O43374 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASA4O43374 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASA4O43374 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASA4O43374 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASA4O43374 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASA4O43374 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASA4O43374 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASA4O43374 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms