Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRXO43186 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRXO43186 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRXO43186 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRXO43186 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRXO43186 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRXO43186 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRXO43186 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRXO43186 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CRXO43186 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRXO43186 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRXO43186 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRXO43186 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRXO43186 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRXO43186 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRXO43186 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRXO43186 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRXO43186 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRXO43186 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRXO43186 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRXO43186 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRXO43186 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRXO43186 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRXO43186 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRXO43186 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRXO43186 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRXO43186 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRXO43186 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRXO43186 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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