Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DYNC1I1O14576 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1I1O14576 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DYNC1I1O14576 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1I1O14576 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms