Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A7O00341 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A7O00341 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A7O00341 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms