Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABARAPH6UMI1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GABARAPH6UMI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPH6UMI1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms