Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49D1C9J1S8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM49D1C9J1S8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49D1C9J1S8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49D1C9J1S8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms