Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN24A6NM45 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN24A6NM45 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN24A6NM45 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms