Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC154A6NI56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC154A6NI56 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC154A6NI56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC154A6NI56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms