Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM49BA6NDI0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM49BA6NDI0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49BA6NDI0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms