Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTAGE9A4FU28 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTAGE9A4FU28 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTAGE9A4FU28 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms