Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCHNA4D1U4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCHNA4D1U4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.9 ms