Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF27A3QJZ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms