Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms