Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRBQ9Y5M8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms