Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms