Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNSTRNQ9Y448 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms