Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms