Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms