Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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