Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF180Q9UJW8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms