Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms